Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GBP1P32455 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GBP1P32455 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBP1P32455 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBP1P32455 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBP1P32455 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBP1P32455 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GBP1P32455 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GBP1P32455 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GBP1P32455 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms