Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CASQ1P31415 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CASQ1P31415 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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CASQ1P31415 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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CASQ1P31415 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CASQ1P31415 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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