Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB4P30926 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms