Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms