Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TSPOP30536 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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