Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GTF2E1P29083 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2E1P29083 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms