Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD247P20963 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD247P20963 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD247P20963 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD247P20963 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms