Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMB1P20618 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB1P20618 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms