Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CXCL3P19876 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CXCL3P19876 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CXCL3P19876 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CXCL3P19876 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CXCL3P19876 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CXCL3P19876 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CXCL3P19876 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL3P19876 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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