Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI3P19429 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms