Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTLA4P16410 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms