Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB3P14651 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB3P14651 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms