Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DOBP13765 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms