Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GLI3P10071 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GLI3P10071 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GLI3P10071 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms