Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF888P0CJ79 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms