Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TIPRLO75663 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms