Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms