Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR3O43761 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms