Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DENRO43583 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DENRO43583 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms