Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BCKDKO14874 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms