Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms