Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD9O00233 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms