Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HHLA1C9JL84 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms