Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD8B2A6NJW9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD8B2A6NJW9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms