Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ08

MBD3L5, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L5A6NJ08 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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MBD3L5A6NJ08 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MBD3L5A6NJ08 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MBD3L5A6NJ08 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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