Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C5orf49A4QMS7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms