Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms