Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms