Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMED7Q9Y3B3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms