Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MED16Q9Y2X0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms