Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THRAP3Q9Y2W1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms