Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms