Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FARSAQ9Y285 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms