Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PALD1Q9ULE6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALD1Q9ULE6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms