Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC2LQ9UL33 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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