Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYTH4Q9UIA0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYTH4Q9UIA0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms