Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NPC1L1Q9UHC9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms