Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA9Q9UGM1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms