Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ABCF2Q9UG63 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms