Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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