Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHPF2Q9P2E5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHPF2Q9P2E5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms