Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRFN1Q9P244 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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