Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CCDC180Q9P1Z9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CCDC180Q9P1Z9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms