Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms