Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms