Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASF1BQ9NVP2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms