Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PNPLA3Q9NST1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms