Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNTG1Q9NSN8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNTG1Q9NSN8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms