Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF275Q9NSD4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms