Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms